1948年12月5日27军必须裁撤，秘密入关的东北野战军先遣兵团，在路过密云县城时准备来个“顺手牵羊”解放它，程子华司令员命令第11纵队的一个师留下来攻城，大部队继续前插平张线，因为据报密云县城仅有敌保安部队、警察等不过2000人。然而仗一打起来却非常艰苦，敌人的顽抗程度超出战前预料，原来是蒋系第13军的三个正规团刚刚从古北口收缩进了密云，使这座小县城的守敌数量骤然增加到6000余人。
（首任军长钱大钧）
兵团司令部只好增调已经西进的另外一个师回头助战，两个师的东野官兵（按东野的普遍编制水平，兵力得有近30000人）经过24小时苦战，全歼守敌解放县城。但如此规模的攻坚战斗也一下子惊了傅作义，因为被消灭的包括第13军之155师两个主力团、297师的一个主力团，而在我华北军区野战部队三个兵团兵力已经使用到极限的情况下，除了强大的东北野战军，没有什么部队能够一天干掉中央军精锐13军的三个团（等于一个主力师了），遂立马知道林彪大军入关了！
这就是遭到西柏坡严厉批评的“胜利的密云战役”，因为它暴露了东野秘密入关的企图，顺手牵羊变成了打草惊蛇，极有可能让被调动出来的35军疯狂逃回北平，影响了平津战役的全盘布局。不过这不是重点，分属两个师的三个步兵团能跟东野未来第48军的两个师硬抗一天，说明蒋系第13军的其实还是可以的。
（次任军长汤恩伯）
在中央军的“陈胡汤”三大军事集团中，第13军正是汤恩伯系统的起家部队，当然，密云战役也是第13军的绝唱，该军主力不久在我军的重重围困下，于北平接受了和平改编，也就标志着这支部队不复存在了。第13军的出身那是绝对的“嫡系”，组建于1933年的长城抗战前夕，首任军长是八大金刚之一的钱大均，下辖孙元良第88师和汤恩伯第89师。
长城抗战结束后，原属第17军的第4师转隶该军，同时钱大均调离，汤恩伯代理军长职。1935年9月30日，汤恩伯正式就任第13军军长，下辖第4师、第89师，从此有了一支自己的基本部队，并且在第13军的基础上，逐渐扩编为第20军团、第31集团军等部，而该军的核心主力，当然就是汤曾经担任师长的第89师。
（黄埔一期王仲廉）
全面抗日战争爆发后的1937年8月初，华北最激烈的战役无疑是“南口战役”，而中方参战的主体就是汤恩伯的第13军，下辖王万龄第4师和王仲廉第89师约28000余人，与日寇板垣第5师团、川岸第20师团一部和二个独混旅团大战14天，死守北平通向整个西北方向的重要门户南口。在日军优势的地空火力打击下，第13军能够以巨大伤亡坚守两周以上，说明这支部队的战斗力在当时的部队中，绝对是第一流的。
在国军的抗日将领中，汤恩伯无疑是被黑化最为严重的一个，主要是他抗战中后期的腐败和无能，但实际上在抗战初期，汤恩伯和他的部队仍然是华北战场上最具战斗力的部队，曾经被日军称为“华北第一大敌”，在南口战役、台儿庄战役和豫南会战中，表现还是可以的。那么作为汤系部队基干的第13军，战力也不会差到哪里去（得跟同行们比较），汤司令升官后，历任军长有鲍刚、张轸、王仲廉、张雪中、石觉等人，尤其后面几位，都是黄埔嫡系将领。
（黄埔一期张雪中）
第13军在抗战中期表现不佳有两大原因，其一是汤恩伯得到第一战区副司令长官和四省边区总司令的职务后，大肆扩充所部军力和个人政治势力，从一名军人沦为了一个政客，失去了之前的锐气，这得算是主将无能。其二是在汤系部队在扩充到四个集团军的过程中，第13军基干部队被频繁调出，期间所属各师番号变动的乱七八糟，始终留在编成内的只有被严重削弱的第89师，其他什么新编师、暂编师不断被调入，战斗力直线下降。问题中所描述的情况，也极有可能发生在这一时期，大抵在1942年到1944年之间。
1944年豫湘桂战役的河南战场惨败后，汤恩伯被撤职，后转任黔桂边区总司令负责在贵阳以南实施反攻，于是整补后的第13军又被调往大西南，不久编入第三方面军建制，参加了湘西会战和收复桂林之战，并因地利之便被加强为半美械军。抗战胜利以后，第13军脱离了汤恩伯的指挥，被划给了熊式辉的东北行营所辖，在杜聿明的指挥下，是第一支攻破山海关八路军阻击阵地进入东北的蒋军部队。
（黄埔三期石觉）
此时的第13军经过调整补充恢复了主力师阵容，下辖第4师、第54师和第89师，确属中央军嫡系主力，战斗力应该处于“五大主力”之下的二流水平，在东北我军尚未形成有效组织和统一指挥的情况下，第13军一路陷兴城、锦州并向我热河解放区进攻，是初期进入东北的蒋军七个军中比较卖力的，当然也是最先遭到打击的。先是在热河战役中被歼2000余人，接着又在著名的“秀水河子”战斗中被消灭一个整团，东北我军由此取得第一次吃掉美械建制部队的胜利。
之后第13军奉命驻守热河首府承德（今属河北），担负热河地区的守备任务和局部机动作战任务，比如第89师就曾被抽出来进攻南满解放区，结果在1947年的“四保临江”战役中被东北野战军全歼。陈诚到任东北后，该军所辖第54师被调出然后又调进一个暂编师，再加上第89师已经属于重建，所以战斗力下滑的比较厉害。1948年5月，热河省被划归“华北剿总”管辖，所以石觉的第13军也就成为了傅作义指挥下的中央军部队。
1948年11月，东北野战军胜利结束辽沈战役时，第13军从承德一路南逃到北平附近，期间黄埔三期的石觉调升新组建的第九兵团司令官（傅部所辖的两个中央军兵团之一），再以曾经的第4师师长、兵团副司令骆振韶（中央军校第六期）兼任第13军军长。并且石觉拼命扩充部队以备平津决战，比如密云战役中出现的第155师、第297师的番号都是此间扩编的，隶属于第九兵团的第13军一度下辖五个师的兵力，不过平均战斗力肯定是下降了，兵贵精不贵多。
平津战役后期，傅作义将军决定起义接受和平改编，为防止蒋系部队不非常命令趁机作乱，答应了南京方面提出的条件，允许中央军师以上将领离开。于是第13军军长骆振韶、副军长胡冠天、参谋长全英以及各师指挥官，都跟随石觉乘机离开北平，而该军所属部队则奉命开出城外，接受人民解放军的改编，至此，组建16年之久的第13军彻底灰飞烟灭。