一四险一险一金、承担主体不同
1、五险一金
养老保险、医疗保险和失业保险，这三种险和住房zhi公积金dao是由企业和个人共同缴纳的保费，工伤保险和生育保险完全是由企业承担的，个人不需要缴纳。医疗保险则是由国家、企业和个人共同承担的。
2、农村合作医疗
采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。
二、包含项目不同
1、五险一金
指用人单位给予劳动者的几种保障性待遇的合称，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险，及住房公积金。
2、农村合作医疗
国家针对农民实施的一项医疗保障制度，不包含其他保险类的制度。
三、实施方式不同
1、五险一金
其中的社会保险是国家通过立法强制实行的，需要用人单位和个人强制缴纳所需部分。
2、农村合作医疗
指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。
扩展资料：
2013年9月11日，国家卫生和计划生育委员会下发《关于做好2013年新型农村合作医疗工作的通知》：
自2013年起，各级财政对新农合的补助标准从每人每年240元提高到每人每年280元。政策范围内住院费用报销比例提高到75%左右，并全面推开儿童白血病、先天性心脏病、结肠癌、直肠癌等20个病种的重大疾病保障试点工作 。
2014年5月27日据财政部网站消息，财政部、国家卫生计生委、人力资源社会保障部4月25日发布《关于提高2014年新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险筹资标准的通知》，2014年新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险筹资方法为：
1、各级财政对新农合和居民医保人均补助标准在2013年的基础上提高40元，达到320元。其中：中央财政对原有120元的补助标准不变，对200元部分按照西部地区80%和中部地区60%的比例安排补助，对东部地区各省份分别按一定比例补助。
2、农民和城镇居民个人缴费标准在2013年的基础上提高20元，全国平均个人缴费标准达到每人每年90元左右。个人缴费应在参保（合）时按年度一次性缴清。
三险一金和五险一金的区别
这两者主要是包含的范围不同：三险一金包括养老保险、医疗保险、失业保险与住房公积金；而五险一金不仅包括养老保险、医疗保险、失业保险、住房公积金，还包括生育保险与医疗保险。
现行我国政府要求用人单位按照规定为职员参加五险一金，三险一金已经成为了过去式。
五险一金缴纳比例：
养老保险【缴费比例】：单位19%(全部划入统筹基金)，个人8%(全部划入个人帐户)。
医疗保险【缴费比例】：单位9%，个人2%+3元。
失业保险【缴费比例】：单位2%，个人1%。
工伤保险单位每个月为你缴纳0。5%，你自己一分钱也不用缴，工伤保险根据单位被划分的行业范围来确定它的工伤费率，在0。5%~2%之间。生育保险单位每个月为你缴纳1%，你自己一分钱也不用缴。
住房公积金【缴费比例】：根据企业的实际情况，选择住房公积金缴费比例。
用人单位按工资的12%办理缴纳住房公积金。单位和个人都是工资的12%。