种子植物中可以分为两类，即和。这两类植物的共同特征是都具有种子这一构造，但这两类植物又有许多重要区别。其中最主要的区别是被子植物的种子生在果实里面，除了当果实成熟后裂开时，它的种子是不外露的，如苹果、大豆即被子植物。裸子植物则不同，它没有果实这一构造。它的种子仅仅被一鳞片覆盖起来，决不会把种子紧密地包被起来。如松塔。它是由许多木质鳞片所形成，它们之间相互覆盖。如果把鳞片剥开，可以看到在每一鳞片下覆盖住两粒有翅的种子。在有些裸子植物中，如银杏，它的种子外面，连覆盖的鳞片也不存在，种子着生在一长柄上，自始至终处于裸露状态。具有这些特性的植物，都称为裸子植物。概括来说，裸子植物和被子植物种子的区别如下被子植物与裸子植物的区别：裸子植物：种子裸露，没有果皮包被，种子的胚具有2至多个子叶，不形成果实。被子植物：种子不裸露，包被在果皮之内，种子的胚具有1或2个子叶，要形成果实。
在所有种子植物中还可以再分为两类，即被子植物和裸子植物。这两类植物的共同特征是都具有种子这一构造，但这两类植物又有许多重要区别。其中最主要的区别是被子植物的种子生在果实里面，除了当果实成熟后裂开时，它的种子是不外露的，如苹果、大豆即被子植物。裸子植物则不同，它没有果实这一构造。它的种子仅仅被一鳞片覆盖起来，绝不会把种子紧密地包被起来。在马尾松的枝条上，会结出许多红棕色尖卵形的松球，当仔细观察时，会看到它是由许多木质鳞片所形成，它们之间相互覆盖。如果把鳞片剥开，可以看到在每一鳞片下覆盖住两粒有翅的种子。在有些裸子植物中，如银杏，它的种子外面，连覆盖的鳞片也不存在，种子着生在一长柄上，自始至终处于裸露状态。具有这些特性的植物，都称为裸子植物。
被子植物与裸子植物的根本区别是种子外面有无果实包被住。但当我们检查某一植物是属于被子植物还是裸子植物时，并不都要去查看一下它们种子的情况，通常从其他一些特点来判断。首先看它是草本还是木本植物，如果是草本植物，那毫无疑问，一定是被子植物，因为裸子植物全部是木本植物。如果碰到的是木本植物，那么先看看有没有花，有花的则是被子植物，因为裸子植物是不开花的。如果碰到没有花的木本植物，则可看叶片，裸子植物的叶片，除了银杏以外，叶形通常狭小，呈针形、鳞形、条形、锥形等。银杏叶片虽宽，但呈展开的折扇状，叶脉二叉分枝，也很容易识别。其他少数裸子植物叶片稍宽一些，也仅仅呈狭披针形。这一部分叶片稍宽的裸子植物也不会同被子植物相混，因为这些裸子植物的叶脉，除中脉外，侧脉都不明显，叶片质地也较厚，都是常绿植物。
根据以上几个方面来被子植物和裸子植物也就不难了。
种子植物在世界上有20余万种，其中绝大部分是被子植物，裸子植物仅占极小的比例，总共只有700余种。被子植物与人类的关系最为密切，衣、食、住、行无不与被子植物相关，各种重要的经济植物，如粮食、油料、纤维、糖料、饮料、香料、橡胶以及药用植物等，都主要来源于被子植物。但裸子植物是木材的宝库，从森林的分布面积和木材的蕴藏量来看，裸子植物都有举足轻重的作用，在我国所生产的木材中，约有3/4是由裸子植物所提供的。
1、形态不同裸子植物：种子裸露，没有皮包裹，裸子植物它们有胚珠（不同于蕨类植物门），但心皮不包成子房，且胚珠裸露，胚乳（即雌性原叶体）在受精前已形成（不同于被子植物门）。被子植物：被子植物种子是由果皮包裹着的。2、种子胚数不同被子植物种子内通常只有一个胚裸子植物大多数种子内有强烈的多胚现象3、花不同裸子植物，有孢子叶球，而无真正的花。被子植物，具有真正的花，被子植物在形态上具有不同于裸子植物所具有的孢子叶球的花。