1与的区别、裸子植物的表面是裸露的，没有果皮包被，例如银杉、水杉等，而被子植物是有果皮包被的，例如我们常吃的苹果、水蜜桃等。
2、被子植物在形态上具有不同于裸子植物所具有的孢子叶球的花；胚珠被包藏于闭合的子房内，由子房发育成果实。
3、被子植物的种子生在果实里面，除了当果实成熟后裂开时，它的种子是不外露的，如苹果、大豆即被子植物。裸子植物则不同，它没有果实这一构造。它的种子仅仅被一鳞片覆盖起来，决不会把种子紧密地包被起来。在马尾松的枝条上，会结出许多红棕色尖卵形的松球。
4、被子植物的主要特征是：具有根、茎、叶、花、果实、种子六种器官，种子不裸露，外面有果皮包被；裸子植物的主要特征是：具有发达的根、茎、叶，种子裸露，没有果皮包被，裸子植物没有花、果实这两个器官。
5、裸子植物除少数类群外，均具有双黄酮类化合物，常见的有穗花杉双黄酮、西阿多黄素、银杏黄素、枯黄素、榧黄素等。黄酮类化合物则普遍存在，常见的有懈皮素、山奈酚和杨梅树皮素等。而人类的大部分食物和营养来源于被子植物，不是直接地通过农作物或园艺作物如谷类、豆类、薯类、瓜果和蔬菜等，就是间接地为牧场提供牲畜所需的饲料。
一，核心区别：
1，裸子植物没有子房和花柱柱头等，胚珠裸露在外，形成的种子没有果皮，只有种皮或假种皮，一般种子外面没有包被，故名“裸子植物”。
被子植物的子房完整，有子房、花柱、柱头等，胚珠包在子房壁里面，发育形成的果实外面有果皮，种子被果皮包着，故称“被子植物”
2，裸子植物的球花不是完全花，仅有大孢子叶小孢子叶，有雌蕊和雄蕊；没有花瓣和花萼。被子植物的花是完全花，有花柄、花托、花萼、花瓣、雄蕊、雌蕊。
二，外面区别
1，裸子植物大部分是木本植物；叶片常窄小，有针形、鳞形等。被子植物木本草本都有；叶片常比较宽大，个别有细小的。
2，裸子植物没有鲜艳的花朵；被子植物多数有鲜艳的花朵。
3，裸子植物的果实常为球果（种子长在鳞片上）和种子。
被子植物的果实是真正的果实。