都是国民党的特务组织，而刚当北方军总司令的时候，还没有那样庞大的特务组织中统军统。是蒋介石第二次下野，才让他下决心建立庞大的特务组织的。
1931年，蒋介石把当时的立法院长胡汉民软禁，反蒋势力掀起倒蒋浪潮，蒋被迫第二次通电下野。
下野后，他痛定思痛，觉得失败的原因在于没有一个能及时掌握党内情况和政敌动向的情报组织。 所以蒋介石复出后立刻开始筹建自己的特务组织，而且一下子组建了两个组织。
这两个组织，一个叫“中国国民党中央执行委员会调查统计局”，简称中统。中统的老大是陈立夫，是蒋介石把兄弟陈其美的侄子，对蒋介石忠心不二，主要负责监视党内干部动向和做政治思想工作。
（陈立夫）
另一个组织叫“国民政府军事委员会调查统计局”，人们叫它军统。则负责对外情报搜集、清除叛徒、内奸。军统刚成立时叫蓝衣社，1938年才改名军统。军统的头头叫戴笠，是蒋介石的同乡，在蒋介石人生低谷的时候投奔了蒋。戴笠胆大心细，有勇有谋且对蒋忠心耿耿，所以戴笠被蒋介石选中。
按说这两个组织都是为蒋介石做事，都归蒋介石领导，又不是上下级关系，应该是井水不犯河水。 但两个组织都在国民党统治区工作，工作性质又相似，都想在主子跟前立功邀宠，一争高下。两个组织也都有人有枪后台硬，一山不容二虎，争斗就不可避免了。
（戴笠）
更可况领导中统陈立夫是国民党元老的侄子，又曾在美国留洋，黄埔军校时就不离蒋左右，辅佐蒋介石打天下，是国民党内有头有脸举足轻重的人物，根本就瞧不起小混混出身的戴笠。
而戴笠仗着蒋介石撑腰，仗着军统劳苦功高，也不把陈立夫当回事。所以戴笠也毫不示弱，处处跟陈立夫对着干。
掌门人都水火不容，手下喽啰更别说了，所以中统军统之间恶斗不断，到了有你无我的地步。
最典型的就是1942年，军统第一杀手赵理君干掉了中统大将韦孝儒，让中统老大陈立夫大为震怒，直接出面为手下报仇，给赵理君扣了个“汉奸”的帽子，逼着蒋介石枪毙了赵理君。
后来戴笠咽不下这口气，又到蒋介石那里举报中统头子徐恩增贪污受贿、走私贩毒。 不过对于两家的争斗，蒋介石倒是成竹在胸，不慌不忙。
因为他知道，两个派别无论怎样争斗，都是为了在他这个总裁跟前争功邀宠。只要他们对自己忠心耿耿，哪怕他们打得头破血流都无所谓。如果他们不吵不闹，不斗不争，闷声不响，反倒是让让人坐卧不安了。
所以每次两家明争暗斗，蒋介石都充耳不闻。真闹得不可开交的时候，就像丈夫处理原配和小妾矛盾那样，要么两边安抚，要么和稀泥，要么就是倒苦水让他们体谅当家人的难处。再不是讲讲都是革命工作，没有高低贵贱，谁也离不开谁的大道理。
总之，让他们相互制约，相互竞争，自己在中间乐享其成。
抗战胜利后，蒋介石眼看两家特务组织势力太大，尾大不掉，怕成心腹大患，就决心削弱他们。
戴笠死后，蒋介石一下子把军统的十万人裁撤到了两万，后来干脆连“军统”这个名字也不要了，改名保密局。而对于中统则培植蒋经国的三青团慢慢取代，后来也干脆取消，改名“内政部调查局”。
在蒋介石眼里，不管是中统还是军统，都是蒋家利用的统治工具，失去了利用价值，自然就飞鸟尽良弓藏了。